从dedecms官网论坛找到个合适的解决方案，打开include/inc/inc_fun_SpGetArcList.php ，将
for($i=0;$i<$ridnum;$i++){
if($tpsql=="") $tpsql .= " And ( (".TypeGetSunID($reids[$i],$dsql,'arc')." Or arc.typeid2='".$reids[$i]."') ";
else $tpsql .= " Or (".TypeGetSunID($reids[$i],$dsql,'arc')." Or arc.typeid2='".$reids[$i]."') ";
}
替换为：
for($i=0;$i<$ridnum;$i++){
if($tpsql=="") $tpsql .= " And (".TypeGetSunID($reids[$i],$dsql,'arc');
else $tpsql .= " Or ".TypeGetSunID($reids[$i],$dsql,'arc');
}
速度快好几倍，原理就是，副栏目不用参与了，极大的提高了运行速度。
不过如果大家的 副栏目 使用的比较多，不建议用。
