编程开发 - 教程之家

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R语言rhdf5读写hdf5并展示文件组织结构和索引数据

前言h5只是一种简单的数据组织格式【层级数据存储格式(HierarchicalDataFormat：HDF)】，该格式被设计用以存储和组织大量数据。在一些单细胞文献中，作者通常会将分析的数据上传...

2023-05-18 00:25:45

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R语言绘制Radar chart雷达图

目录更新前原文作图方法：Step1.绘图数据的准备Step2.绘图数据的读取Step3.绘图所需package的安装、调用Step4.绘图数据格式调整Step5.绘图填充透明度调整方法如下：1.取消编组2...

2023-05-18 00:25:43

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R语言数据可视化绘图Lollipop chart棒棒糖图

目录Step1. 绘图数据的准备Step2. 绘图数据的读取Step3.绘图所需package的调用Step4.因子水平排序Step5.绘图今天给大家分享的是Lollipop chart(棒棒糖图)的画法。棒棒糖图...

2023-05-18 00:25:19

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R语言绘制Bubble Matrix气泡矩阵图

目录Step1. 绘图数据的准备Step2. 绘图数据的读取Step3.绘图所需package的安装、调用Step4.绘图Step5.美化又是一个好久不见，朋友们你们最近还好吗！最近小仙同学刚经历了人生...

2023-05-18 00:25:14

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R语言模拟疫情传播图RVirusBroadcast展示疫情数据

目录前言效果展示小结参考附录：RVirusBroadcast代码前言前几天微博的一个热搜主题是**“计算机仿真程序告诉你为什么现在还没到出门的时候！！！”**，该视频用模拟的疫情...

2023-05-18 00:25:10

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基于R语言数据检验详解

目录1. W检验（Shapiro–Wilk (夏皮罗–威克尔 ) W统计量检验)2. K检验(经验分布的Kolmogorov-Smirnov检验)3. 相关性检验：4. T检验5. 正态总体方差检验6. 二项分布...

2023-05-18 00:24:45

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R语言日期时间的使用

目录1.日期和日期时间类型2.从字符串生成日期数据3.日期显示格式4.访问日期时间的组成值5.日期舍入计算6.日期计算 6.1 时间长度 6.2 时间周期 6.3 时间区间7.基本R...

2023-05-18 00:24:40

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R语言实现PCA主成分分析图的示例代码

目录简介开始作图1. PCA 分析图本质上是散点图2. 为不同类别着色3. 样式微调简介主成分分析（Principal Component Analysis，PCA）是一种无监督的数据降维方法，通过主成分分析可以...

2023-05-18 00:24:31

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R语言利用ggplot2绘制QQ图和箱线图详解

目录绘制qq图函数介绍例子绘制boxplot函数介绍例子利用分位点绘制箱线图将QQ图和箱线图进行融合函数介绍参数介绍注意事项例子绘制qq图在ggplot2中绘制qq图需要两步，geom_qq(...

2023-05-18 00:24:26

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R语言学习VennDiagram包绘制韦恩图示例

目录引言一需要安装和导入的包二使用函数及参数三知道各个数据集的个数以及重叠（交叉）的个数2.1 两个已知数据集的韦恩图2.2 三个已知数据集的韦恩图四根据数据集合绘制韦...

2023-05-18 00:24:24

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R语言行筛选的方法之filter函数详解

目录1. 数据2. 生成ID列和类型3. 提取effect大于0.1的行4. 提取加性效应，且effect小于0的行5. 根据部分行名删选6. 固定字符特征进行行筛选总结下面介绍一下R语言中行筛选的...

2023-05-18 00:24:10

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R语言数可视化Split violin plot小提琴图绘制方法

最近小仙同学在好几篇文献里看到了这种小提琴图，暂时就肤浅地认为这是作者为了更好地比较对照组与实验组的差别，所以将同一个基因的小提琴图各画了一半，放在一起。为了跟上可视...

2023-05-18 00:23:56

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R语言绘制小提琴图violin plot实现示例

目录Step1. 绘图数据的准备Step2. 绘图数据的读取Step3.绘图所需package的安装、调用Step4.绘图Step5.美化即便小仙同学决定学习R语言来提升自己作图的“逼格”的...

2023-05-18 00:23:51

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R语言数据类型与相应运算的实现

目录一、常量与变量1.常量 2.变量二、数据类型三、数值型向量3.1 c() 函数3.2 length(x)3.3 numeric()四、向量运算1.标量和标量运算2.向量与标量运算3.等长向量运...

2023-05-18 00:23:48

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R语言绘制line plot线图示例详解

目录Step1. 绘图数据的准备Step2. 绘图数据的读取Step3. 绘图所需package的安装、调用Step4. 绘图最近小仙同学在Nature Cell Biology上看到了这样一张图，很常见的折线图画成...

2023-05-18 00:23:45

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R语言因子类型的实现

目录1.因子2.table() 函数3.tapply() 函数4.forcats 包的因子函数1.因子 R 中用因子代表数据中分类变量 , 如性别、省份、职业。有序因子代表有序量度，如打分结果，疾病...

2023-05-18 00:23:17

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R语言绘图学习教程VennDiagram绘制venn

目录导读一、模拟输入二、venn基础图三、个性化参数调整四、保存导读使用VennDiagram函数包中的venn.diagram函数绘制三数据集venn图。安装依赖包：# venn图install.packages(...

2023-05-18 00:23:10

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R语言绘制corrplot相关热图分析美化示例及详细图解

目录介绍1.加载包2.加载数据3.绘图4.个性化设置聚类方法5.个性化添加矩阵6.颜色设置介绍R corrplot包提供了一个在相关矩阵上的可视化探索工具，该工具支持自动变量重新排序，...

2023-05-18 00:23:05

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R语言多元线性回归实例详解

目录一、模型简介二、求解过程总结一、模型简介一元线性回归是一个主要影响因素作为自变量来解释因变量的变化，在现实问题研究中，因变量的变化往往受几个重要因素的影响，此时就...

2023-05-18 00:22:45

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R语言两组变量特征相关关系热图绘制画法

目录准备数据简单热图只对列进行聚类将相关系数显示在图上在图上加上显著性标记准备数据两组变量的数据可以像下面这样处理，分别保存在两个csv文件中。> # 导入数据及数据预...

2023-05-18 00:22:33

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R语言学习之线图的绘制详解

目录线图单线图多线图横轴文本线图线图线图是反映趋势变化的一种方式，其输入数据一般也是一个矩阵。单线图假设有这么一个矩阵，第一列为转录起始位点及其上下游5 kb的区域，第二...

2023-05-18 00:22:28

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R语言逻辑型运算的实现

目录一、逻辑型向量与比较运算二、逻辑运算三、逻辑运算函数一、逻辑型向量与比较运算逻辑型是 R 的基本数据类型之一，只有两个值 TRUE 和 FALSE, 缺失时为 NA。...

2023-05-18 00:22:23

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R语言使用gganimate创建可视化动图

目录前言加载R包，数据ggplot2绘制gganimate 动态参考资料前言介绍一个主要用于绘制动画的ggplot2的扩展包---gganimate包。Hans Rosling的关于“New Insights on Povert...

2023-05-18 00:22:17

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R语言绘制维恩图ggvenn示例详解

目录引言1.安装2.基础用法3.图形美化4.提取交集部分并输出引言韦恩图，Venn diagram，常用图的一种，用来展示集合之间的特异性和共同性。现在有很多在线的网站都可以绘制，但是R来...

2023-05-18 00:21:57

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R语言实现KMeans聚类算法实例教程

目录什么是k-means聚类算法R 实现kmeans聚类算法加载包加载示例数据寻找最佳聚类数量使用最优k执行kmeans聚类kmeans 算法的优缺点总结本文和你一起学习无监督机器学习算法...

2023-05-18 00:21:54

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R包clusterProfiler如何安装成功(新手必看!)

目录前言看重点：正确的安装方式1. 在CRAN中用install.packages()安装2. 安装bioconductor报错3. 正确而顺利的安装方法3.1 安装最新版R3.2 安装Rtools4.23.3 配置镜像3.4 正...

2023-05-18 00:21:51

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R语言ggplot2图例标签、标题、顺序修改和删除操作实例

目录1. 修改图例标注/标签2. 修改图例标题名称3. 隐藏/删除图例标题标题修改、删除4.图例位置5. 删除图例总结1. 修改图例标注/标签内容修改、序列修改##标注排序修改break...

2023-05-18 00:21:48

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R语言泊松(Poisson)分布实例详解

目录前言The Poisson DistributionDescriptionUsageArguments1.泊松(Poisson)分布中抽样函数rpois 2.泊松分布概率密度函数3.累积概率4.qpois函数(ppois的反函数)总结前言Po...

2023-05-18 00:21:45

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详解R语言caret包trainControl函数

目录trainControl参数详解源码参数详解示例trainControl参数详解源码caret::trainControl <- function (method = "boot", number = ifelse(grepl("cv", method), 10, 25),...

2023-05-18 00:21:41

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R语言ggplot2图例修改超详细介绍

目录前言移除图例改变图例位置修改图例的边框和背景改变图例顺序反转图例顺序修改图例标题修改图例标题外观移除图例标题修改图例标签修改图例标签外观总结前言大家经常对gg...

2023-05-18 00:21:39

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解决R语言报错:Error in y + 1:non-numeric argument to binary operator

目录报错信息：报错原因：原代码：报错原因解析：总结因为花了2天半才解决，中间痛苦的寻找，记录一下解决的流程与经验报错信息：1Error in y + 1 : non-numeric argument to binary oper...

2023-05-18 00:21:37

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基于R语言时间序列的平稳时间序列模型预测图文详解

本次数据以某地1958到2021年降水量数据为例首先导入所需要的包，并加载；读取数据并将数据转换为时间序列数据，起始时间设为1958年平稳性检验：由上时序图可知该序列波动范围有界，初...

2023-05-18 00:21:34

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R语言ggplot2 title设置教程(main,axis和legend titles)

目录1. ggplot2中添加title函数2. 实际应用（1）添加title、xlab和ylab（2）修改legend名字（3）修改title的字体，位置，颜色等（4）删除xlab和ylab总结1. ggplot2中添加title函数ggtitle(label...

2023-05-18 00:21:27

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R语言学习之字符串和时间格式化详解

目录字符串格式化转义字符时间格式化字符串函数字符串格式化R语言字符串可用单引号' '或双引号" "来表示，二者唯一的区别是，单引号字符串不含单引号，双引号字符串不含...

2023-05-18 00:21:25

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R语言学习之基础绘图详解

目录散点图曲线图条形图饼图R语言内置了一些基础的绘图函数，主要包括散点图曲线图条形图饼图plotcurvebarplotpie这些绘图函数参数各异，但有个别参数相对来说比较通用，包括main...

2023-05-18 00:21:23

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利用R语言合并数据框的行与列实例代码

目录合并数据框的行与列一、rbind()和cbind()函数二、merge()函数总结合并数据框的行与列大家好，这里是想做生信大恐龙...

2023-05-18 00:21:20

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关于R语言包的升级与降级问题

R语言包的升级与降级这篇博客只是记录一下在使用偏最小二乘判别分析时遇到的一些问题: 暑期实习期间曾自行使用R语言caret包进行机器学习某些方法的训练，在训练过程中需要对...

2023-05-18 00:21:18

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R语言初学者的一些常见报错指南

目录前言第一类：工作路径问题未设定工作路径当前路径需要修改第二类：对象名或函数名问题未找到函数名报错函数名大小写问题未找到赋值对象对象赋值不规范第三类：符号问题中文逗...

2023-05-18 00:21:13

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R语言在散点图中添加lm线性回归公式的问题

目录1. 简单的线性回归2. 使用ggplot2展示1. 简单的线性回归函数自带的例子（R 中键入?lm），lm(y ~ x)回归y=kx + b， lm( y ~ x -1 )省略b，不对截距进行估计：require(graphics)## An...

2023-05-18 00:21:05

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R语言实现各种数据可视化的超详细教程

目录1 主成分分析可视化结果1.1 查看莺尾花数据集(前五行，前四列)1.2 使用莺尾花数据集进行主成分分析后可视化展示2 圆环图绘制3 马赛克图绘制3.1 构造数据3.2 ggplot2包的g...

2023-05-18 00:21:01

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R语言绘图基础教程(新手入门推荐!)

目录一、R语言绘图初阶1、图形参数2、符号和线条3、颜色4、文本属性5、图形尺寸与边界尺寸6、添加文本、自定义坐标轴和图例7、图形的组合二、R语言基本图形绘制1、条形图1....

2023-05-18 00:20:53

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R语言apply系列函数实例详解

目录前言一、apply()函数二、lapply()函数三、sapply()函数四、tapply()函数五、mapply()函数总结前言在R语言中，apply系列函数可以对向量、矩阵、数据框一次性对整体数据应...

2023-05-18 00:20:44

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R语言基础数据类型的具体使用

目录一、数据类型1.数值型（Numeric）2.字符型（character）3.逻辑型（logical）二、数据类型判断与转换1.数据类型判断2.数据类型转换R语言主要有三种基本的数据类型，分别是数值型（Numeri...

2023-05-18 00:20:42

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使用R中merge()函数合并数据的方法

目录使用R中merge()函数合并数据如何使用merge()获取数据集中交叉部分如何理解不同类型的合并如何实现完整合并(full outer join)总结使用R中merge()函数合并数据在R中可以...

2023-05-18 00:20:41

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R语言中aggregate 函数详解

目录R语言中aggregate 函数001、测试数据框002、调用函数R语言中aggregate 函数aggregate函数是数据处理中常用到的函数，具有强大的功能。可以按照要求把数据打组聚合，然后对...

2023-05-18 00:20:38

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如何使用R语言做逻辑回归详解

目录前言首先加载需要用的包接下来建模最后我们可以根据模型来预测啦总结前言回归的本质是建立一个模型用来预测，而逻辑回归的独特性在于，预测的结果是只能有两种，true or fal...

2023-05-18 00:20:35

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R语言中ggplot2绘制双坐标轴图

R包ggplot2绘图精美，可以做出很复杂的图形，深受用户喜爱。它的作者hadley并不推荐使用ggplot2绘制双坐标轴图，认为这样会增加读图的难度，但是目前需要双坐标轴图应用的场景还是...

2023-05-18 00:20:33

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R语言将变量分组的3种方法实例(含cut函数说明）

目录前言方法一：直接对分组变量进行赋值方法二：使用within函数对变量进行分组方法三：采用cut函数总结前言在数据处理的过程中，我们有时候需要将连续的数值数据转换为类别数据，比...

2023-05-18 00:20:27

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R语言中set.seed()函数的作用详解

目录001、首先查看不使用set.seed函数的情况002、使用set.seed函数的情况003、改变种子序号的情况R语言中set.seed()函数的作用是保证前后生成的随机数保持一致。001、首先...

2023-05-18 00:20:24

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使用ggsignif优雅添加显著性标记详解

目录引言PART1：安装PART2：函数部分参数详解PART3：示例——以ggplot2内置数据集mpg为例PART4：来点花的——何必一定是显著性标记？PART5：让图“躺”...

2023-05-18 00:20:19

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